Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms