Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms