Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms