Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms