Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM30AQ9NV96 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms