Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBRD1Q9NUN5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms