Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms