Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PFDN4Q9NQP4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms