Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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