Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ELL3Q9HB65 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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