Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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