Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms