Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf88Q9BSF0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms