Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms