Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOL4Q9BPW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms