Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms