Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms