Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms