Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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UBE2E3Q969T4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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UBE2E3Q969T4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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UBE2E3Q969T4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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