Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms