Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPBAR1Q8TDU6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms