Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TMIEQ8NEW7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIEQ8NEW7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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