Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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