Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms