Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms