Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRC28Q86X40 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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