Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms