Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms