Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms