Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TNS3Q68CZ2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNS3Q68CZ2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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