Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms