Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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