Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKDCCQ504Y2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms