Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms