Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms