Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms