Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms