Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
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