Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EBI3Q14213 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms