Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms