Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms