Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms