Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms