Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
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