Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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