Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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