Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms