Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX10Q12887 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms