Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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