Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNA1Q09470 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms